导致房地产权证难办的原因有：
一、房地产开发公司拖欠地价款。
土地所有权属国家，任何个人或单位使用国有土地都必须缴纳一定的土地使用权出让款(即地价款)给政府。它是办理《房地产权证》的个人或单位不可或缺的必要条件之一。按照国家的相关法律法规文件规定，办理产权证，必须要有国土资源和房屋管理局计财科关于该用地已交清地价款的清单。因此，房地产开发企业在开发或经营过程中拖欠政府地价款，便相应地使业主在办理房地产权证时难以受理。
例如：地处****路的某花园的房地产开发公司拖欠政府地价款达一千三百多万，直接造成一千余住户无法办理《房地产权证》。在建设路的某楼房，同样是因房地产开发公司拖欠政府地价款，造成60余户不能办证，但此开发公司拖欠款项只有十万元。像后者拖欠款项不是很多的情况，《房地产权证》的办理有望在各部门的协调下，在近期内得到解决。
二、房地产开发公司经营不善，无资金办证。
由于房地产开发公司自身经营不善或开发投资决策出现重大失误，使公司的各项运作因缺少资金而难以为继，处于停产或破产状态，不能筹集到办证所需的各项费用。
房产开发商未交纳办证费用，实际上就意味着业主办理《房地产权证》所需的后续资金完全缺失，办证也是陷于无米下炊的境况。因此，像由这种情况而引发的集体上诉、重复上诉在整个投诉比率中占据着相当的比重。
三、办证资金被挪作他用。
购房业主向公司缴交办证费，但由于一些房地产开发公司内部管理混乱，不仅未能做到专款专用，还被公司挪作他用，从而造成缺乏足够的资金办理《房地产权证》。
四、房地产开发公司对挂靠行为管理不严，责任归属不清。
开发公司只顾眼前利益，对挂靠者未能进行长期有力的监督管理，引发问题，相互推搪责任，令问题变得复杂化。
五、销售面积和产权登记面积有差异。
业主在进行产权登记时，发现实际面积与销售面积有差异(即缩水楼)，同开发公司有争议，从而使事情搁浅。面积缩水最直接的反应，就是业主认为应该退还其多交纳的房款。
六、开发公司销售无证商品房，手续不完善。
一些开发商无取得合法开发权，违规开发商品房，违规销售，造成无法办理产权证。对于这种情况的形成，自然开发公司有着不可推卸的责任。
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